Скачиваем последнюю версию (на текущий момент 4.8.2)
$ wget https://files.phpmyadmin.net/phpMyAdmin/4.8.2/phpMyAdmin-4.8.2-all-languages.zip
Распакуем архив:
$ unzip phpMyAdmin-4.8.2-all-languages.zip
Переходим в директорию с установленным pma
$ cd /usr/share/phpmyadmin/
Удаляем все файлы старой версии
$ sudo rm -Rf *
Переходим в директорию с загруженным pma
$ cd /Загрузки/phpMyAdmin-4.8.2-all-languages
Теперь переносим все файлы
$ sudo mv * /usr/share/phpmyadmin/
Перезапускаем апач
$ sudo service apache2 restart
Перезапускаем мускул
$ sudo service mysql restart
Проверяем версию phpMyAdmin
